本周分享文献：PhenotypicHeterogeneityandGenotypicSpectrumofInbornErrorsofImmunityIdentifiedthroughWholeExomeSequencinginaThaiPatientCohort，于年11月19日在线发表在PediatricAllergyandImmunology(IF=6.)上。

原发性免疫缺陷病(PID)，包括多种可能危及生命的罕见病。临床表现和遗传缺陷在人群中具有异质性和多样性。在此，本文作者旨在描述泰国PID儿童患者的临床、免疫学和遗传特征。此外，还评估了全外显子组测序(WES)在诊断和临床决策中的应用。

研究方法

◆从年1月至年12月，招募了36名临床和实验室检查结果与PID一致的无血缘关系的患者。WES被用来确定潜在的遗传缺陷。在知情同意后，从患者及其父母身上采集了3毫升外周血。从外周血白细胞中提取基因组DNA。将DNA样品制备为测序文库，并在外显子组捕获步骤中获取。如果这些变异存在于本文作者提及的2,个无关联的泰国外显子组的内部数据库中，则随后将其过滤掉。如果这些变异未在ClinVarMiner数据库和基因组聚合数据库(GnomAD)中列出，则它们将被称为新变异。所有新的潜在致病变异，均通过PCR-Sanger测序得到确认。

研究结果

◆共有36名临床诊断为PID的患者被纳入，并接受了WES。发病的中位年龄为4个月(范围：1个月至13岁)，24人(66.7%)为男性。最常见的临床表现是复发性窦肺道感染(33.3%)，其次是败血症(30.6%)和重症肺炎(16.7%)。

◆进行了全外显子组测序(WES)，以便研究所有36例病例的遗传缺陷。根据美国医学遗传学和基因组学会/分子病理学协会(ACMG/AMP)的变异分类指南，在18例(50%)中鉴定出20种变异，包括致病性、可能致病性和解释患者表型无确定意义的变异(原文表2)。

详见原文表2：在PID患者中发现的诊断变异

◆在确定的20种变异中，有6种(30%)是新的(原文表3)。这些变异包括八个错义突变、六个移码突变、三个剪接突变、两个无义突变和一个框内突变。根据IUIS分类，发现7例病例含有与II类基因相关的变异：具有相关或综合征特征的联合免疫缺陷；有4例在I类中：影响细胞和体液免疫的免疫缺陷；3例既在III类中：主要是抗体缺陷；也在IV类中：免疫失调疾病；1例在V类中：先天性吞噬细胞数量或功能障碍。在分类为VI-X类的基因中，未发现变异(图1)。

详见原文表3：在PID患者中发现的新变异

详见原文图1：按IUIS分类的PID患者的分子发现

发现新的PID相关基因，可以为人类免疫系统中涉及到的通路提供分子见解，并扩展我们对PID或免疫相关疾病背后的分子机制的了解。这可能会带来新的治疗机会，从而改善患者的预后。总之，这项研究是 次也是 的一次研究泰国人群中儿科PID病例的遗传原因。在50%的病例中，WES被成功地用于识别遗传缺陷。在发现与这些疾病相关的所有20个变异中，有6种(30%)是新的。本文作者的发现，还证明了PID的遗传和表型异质性，支持在诊断和临床决策中使用WES。

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